Що таке пошук подібності послідовності за допомогою BLAST?
знаходить області подібності між біологічними послідовностями. Програма порівнює нуклеотидні або білкові послідовності з
і обчислює статистичну значущість. Дізнайтесь більше. Базовий інструмент пошуку локального вирівнювання (BLAST) знаходить області локальної подібності між послідовностями.
Базовий інструмент пошуку місцевих вирівнювань (BLAST) знаходить ділянки локальної подібності між білковими або нуклеотидними послідовностями. Програма порівнює нуклеотидні або білкові послідовності з послідовністю в базі даних і обчислює статистичну значущість збігів.
Пошук подібності послідовності може ідентифікувати «гомологічні» білки або гени шляхом виявлення надмірної подібності – статистично значущої подібності, яка відображає спільне походження.
Пошук схожості послідовності BLAST
- Виберіть вкладку «Blast» на панелі інструментів у верхній частині сторінки, щоб запустити пошук подібності послідовності за допомогою програми Blast.
- У поле форми введіть послідовність білка чи нуклеотиду або ідентифікатор UniProt (Малюнок 38 – інтерактивне зображення).
- Виберіть цільову базу даних.
Базовий інструмент пошуку локального вирівнювання (BLAST) Програма порівнює нуклеотидні або білкові послідовності та обчислює статистичну значущість збігів. BLAST можна використовувати зробити висновок про функціональні та еволюційні зв’язки між послідовностями, а також допомогти ідентифікувати членів родин генів.
Результати вибуху сортуються за значенням E за замовчуванням (найкращий удар у першому рядку). Чим менше значення E, тим кращий збіг. Вибухові удари з E-значенням менше 1e -50 включають збіги бази даних дуже високої якості. Вибухові удари з E-value менше 0,01 все ще можна вважати хорошим ударом для збігів гомології.