Що таке прийнятний FDR?

Коли ви звітуєте про свої результати, вам слід зробити FDR 0,1 або 0,05 якщо у вас немає поважних причин цього не робити. Ваш звіт буде відповідати літературі, оскільки інші люди також використовують 0,1 або 0,05. Якщо ви встановите для FDR приблизно 0,0456, ваш документ може бути відхилено через невідповідність. 22 грудня 2016 р.

GSEA рекомендує порогове значення FDR 0,25 під час роботи в режимі зміни фенотипу. Загалом у режимі набору генів краще використовувати поріг 0,05 лише на основі характеру тесту, що виконується. Тим не менш, граничний результат, як цей, потенційно варто дослідити іншими методами.

5% Порогове значення q 0,05 дає FDR 5% серед усіх функцій, які називаються значущими.');})();(function(){window.jsl.dh('1pnrZpaBHebEp84P_b-RiAk__33','

Скориговане на FDR значення p (також називається q-значенням) 0,05 означає, що 5% значущих тестів призведуть до помилкових позитивних результатів. Іншими словами, FDR у 5% означає, що серед усіх результатів, які називають значними, лише 5% з них дійсно нульові.

FDR 0,05 вказує на це приблизно 5% значущих результатів насправді є хибнопозитивними.

Простіше кажучи, FDR = FP / (FP + TP). Процедури FDR-контролю забезпечують менш суворий контроль помилок типу I порівняно з процедурами контролю частоти помилок (FWER) (такими як корекція Бонферроні), які контролюють ймовірність принаймні однієї помилки типу I.