Яка різниця між секвенуванням ДНК Гілберта та Сенгера?

Метод Максама–Гілберта спочатку використовувався ширше, ніж секвенування Сенгера, оскільки його можна було виконувати з дцДНК, тоді як метод Сенгера вимагав клонування для отримання оцДНК перед секвенуванням. Однак із впровадженням нових технологій і обладнання метод Максама–Гілберта припинився. 9 липня 2018 р.

Секвенування Максама-Гілберта Аллан Максам і Волтер Гілберт опублікували метод секвенування ДНК у 1977 році, заснований на хімічна модифікація ДНК і подальше розщеплення за певними основами. Також відомий як хімічне секвенування, цей метод дозволяв використовувати очищені зразки дволанцюгової ДНК без подальшого клонування.

Секвенування ДНК — це процес визначення послідовності нуклеотидів (As, Ts, Cs і Gs) у фрагменті ДНК. При секвенуванні Сенгера цільова ДНК копіюється багато разів, утворюючи фрагменти різної довжини.

З іншого боку, секвенування по Сенгеру залишається популярним для секвенування короткої області в невеликій кількості зразків, оскільки він може точно зчитувати до 1000 пар основ, не вимагаючи складного аналізу даних.

Критична різниця між секвенуванням Сенгера та NGS полягає в тому обсяг секвенування. У той час як метод Сенгера секвенує лише один фрагмент ДНК за один раз, NGS є масово паралельним, тобто секвенує мільйони фрагментів одночасно за цикл.

Метод Максама–Гілберта спочатку використовувався ширше, ніж секвенування Сенгера, оскільки його можна було виконувати з дцДНК, тоді як метод Сенгера вимагав клонування для отримання оцДНК перед секвенуванням. Однак із впровадженням нових технологій і обладнання метод Максама–Гілберта припинився.