Який функціональний стан хроматину?

Функціональний стан хроматину, тобто здатність його ДНК служити праймером у синтезі РНК, зазвичай вивчається біохімічними (in vivo) і молекулярно-біологічними (in vitro) методами.

Загалом існує три рівні організації хроматину: ДНК обертається навколо білків-гістонів, утворюючи нуклеосоми та так звані кульки на нитковій структурі (еухроматин). Кілька гістонів загортаються в 30-нанометрове волокно, що складається з масивів нуклеосом у їх найбільш компактній формі (гетерохроматин).

Основною функцією хроматину є щоб упакувати ДНК в одиницю, здатну поміститися в тісному просторі ядра. Існує дві форми хроматину — еухроматин і гетерохроматин. Еухроматин складається з сегментів ДНК, які беруть участь у реплікації та транскрипції.

Основною повторюваною структурною (і функціональною) одиницею хроматину є нуклеосому, який містить вісім білків-гістонів і близько 146 пар основ ДНК (Van Holde, 1988; Wolffe, 1999).

Ці інтегровані мережеві функції також називаються функціональними станами, і вони відповідають спостережуваним біологічним функціям або фенотиповим станам, які створюють мережі. Функціональний стан можна розглядати як результат виконання генетичної програми, записаної в ДНК.

Відкритий хроматин є Фракції ДНК, доступні транскрипційному механізму (включаючи зв’язаний TF і кофактори для регулювання генів і регулятор хроматину (CR), що модулює стан хроматину.) і додатково впливає на експресію генів (вмикає або вимикає гени).