Який інструмент ми використовуємо з UCSC Genome Browser?

Команда UCSC Genome Browser розробляє та оновлює такі основні інструменти: Переглядач генома, BLAT, In-Silico PCR, Переглядач таблиць і LiftOver. Ми підтримуємо такі менш використовувані інструменти: Gene Sorter, Genome Graphs і Data Integrator.

Доступ до даних можна отримати за цією URL-адресою: https://api.genome.ucsc.edu/ Додаючи різні функції кінцевої точки, такі як /list/ або /getData/ можна отримати певні результати.

UCSC Genome Browser представляє різноманітну колекцію наборів анотаційних даних (відомих як «треки» та представлених у графічному вигляді), включаючи вирівнювання мРНК, відображення повторюваних елементів ДНК, прогнози генів, дані про експресію генів, дані про асоціації захворювань (що представляють зв’язки генів до хвороб) і відображення …

Деякі з основних використовуваних інструментів включають ферменти рестрикції, які розщеплюють дволанцюгову ДНК у певних областях, і електрофорез у гелі, який розділяє фрагменти ДНК відповідно до розміру та заряду. Клонуючі вектори також є життєво важливими інструментами в проекті геному.

Окрім генних анотацій, браузери геномів можуть відображати різні типи даних, наприклад: Послідовність ДНК: Це може бути показано як одна лінійна доріжка або як кілька доріжок, різними кольорами позначаючи різні особливості (наприклад, екзони, інтрони та повтори).

Завантаження з веб-браузера Якщо вам незручно користуватися командним рядком, ви можете завантажити свій файл через FTP у вашому браузері за адресою ftp://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath або з нашої сторінки завантажень за адресою http://hgdownload.soe.ucsc.edu/downloads.html.