Яка різниця між hg19 і hg38 UCSC?

По суті, чим GRCh Build 38 відрізняється від hg19? Конструкція hg19 є єдиним представленням кількох геномів. Збірка GRCh Build 38 надає альтернативні послідовності («alt_sequences») для деяких геномних регіонів, для яких їхня варіативність перешкоджає адекватному представленню одним посиланням.

HG38 — це оновлена ​​версія попередньої збірки GRCh37, широко відомої як HG19. У 2022 році консорціум Telomere-to-Telomere (T2T)3 випустив більш сучасну версію еталонного геному людини.

GRCh38/hg38 є збірка геному людини, випущена в грудні 2013 року, яка використовує альтернативні або ALT-контиги для представлення загальної складної варіації, включаючи локуси HLA. Альтернативні контиги також були присутні в минулих збірках, але не в тій мірі, яку ми бачимо з GRCh38.

Поки hg19 і GRCh37 мають однаковий геном, UCSC додає "chr" на початку назв хромосом, наприклад, chr1, chr2 тощо. З іншого боку, Ensembl залишає хромосоми такими, як є: 1, 2 тощо. Іншою відмінністю є мітохондріальний геном, який UCSC позначає chrM, а Ensembl — MT.

GRCh37 hg19 еквівалентний ГРЧ37.');})();(функція(){window.jsl.dh('orfrZorANYPHp84P0b6y8QE__41','

Як номери випусків UCSC відповідають показникам інших організацій, наприклад NCBI?