Який метод ПЛР для виявлення однонуклеотидної мутації?
Методи на основі ПЛР для виявлення SNP/мутації загалом поділяються на два типи—(1) поліморфний або мутантний алель-спрямований специфічний аналіз з використанням праймерів, зіставлених із заміщеним нуклеотидом, або використанням олігонуклеотидів для блокування чи затискання нецільової матриціта (2) аналіз кривої плавлення, який поєднується з …
Хімічна структура, заряд або взаємодія з матрицею та ДНК-полімеразою можуть сприяти цим відмінностям. Щоб це встановити PR-ПЛР може виявити однонуклеотидні мутації, PR-PCR використовували для ідентифікації переходу C→T у кодоні 282 (нуклеотид 14513) у P53 клітин HaCaT (рис.
Він включає в себе виявлення зміни одного нуклеотиду за допомогою протоколу прямої послідовності. SNP зустрічаються як у кодуючих, так і в некодуючих областях геному. Технології виявлення SNP використовуються для пошуку нових поліморфізмів і визначення алеля(ів) відомого поліморфізму в цільових послідовностях.
ПЛР-ПДРФ можна використовувати, якщо дискримінантні сайти рестрикції були знайдені на сайтах SNP для певного виду. Цільовий SNP можна розрізнити за допомогою травлення за допомогою специфічних рестрикційних ферментів, які розрізають лише і спеціально в цих місцях. Ферменти рестрикції були відібрані за допомогою програмного забезпечення SNP-RFLPing 2 (Chang et al., 2010).
Два поширені методи, які використовуються для виявлення та кількісного визначення продукту, включають (1) флуоресцентні барвники, які неспецифічно інтеркалюють дволанцюгову ДНК та (2) ДНК-зонди, специфічні для послідовності, що складаються з флуоресцентно мічених звітів.
Методи на основі ПЛР для виявлення SNP/мутації загалом поділяються на два типи—(1) поліморфний або мутантний алель-спрямований специфічний аналіз з використанням праймерів, зіставлених із заміщеним нуклеотидом, або використанням олігонуклеотидів для блокування чи затискання нецільової матриціта (2) аналіз кривої плавлення, який поєднується з …