Що таке metaMDS?
Функція metaMDS виконує
(NMDS) і намагається знайти стабільне рішення за допомогою кількох випадкових запусків. Крім того, він стандартизує масштабування в результаті, щоб конфігурації було легше інтерпретувати, і додає бали видів до ординації сайту.
Подробиці. Неметричне багатовимірне шкалювання (NMDS) зазвичай вважається найбільш надійним необмеженим методом ординації в екології громади (Мінчін 1987). функція metaMDS — це функція-обгортка, яка викликає декілька інших функцій для об’єднання рекомендацій Мінчіна (1987) в одну команду.
NMDS зазвичай добре справляється з представленням складних багатовимірних даних у невеликій кількості вимірів (зазвичай 2 або 3). В результаті його часто використовують для зменшення та візуалізація даних. NMDS іноді використовується просто для зменшення даних.
Мета NMDS – представляти положення об'єктів (наприклад, громад) у багатовимірному просторі якомога точніше, використовуючи зменшену кількість вимірів, які можна легко візуалізувати (подібно до PCA).
Як правило, ординація NMDS зі значенням стресу близько або вище 0,2 вважається підозрілою, а значення стресу, що наближається до 0,3, вказує на те, що ординація довільна. Значення стресу, що дорівнює або нижче 0,1, вважаються справедливими, тоді як значення, що дорівнюють або нижче 0,05, вказують на хорошу відповідність.
опис. Функція metaMDS виконує неметричне багатовимірне масштабування (NMDS) і намагається знайти стабільне рішення за допомогою кількох випадкових запусків.